基于形态学与核糖体DNA及其cDNA高通量测序的海洋沉积物中纤毛虫多样性比较     

黄平平  赵峰  徐奎栋 《海洋与湖沼》2017,48(2):285-296

高通量测序技术广泛应用于环境真核微生物多样性的研究,可检获较之传统形态学方法更高的多样性。然而,检获的高分子多样性与基于形态的物种多样性在构成上的差异仍然不明。本研究首次对比分析了基于形态学的南黄海沉积物中的纤毛虫物种多样性与基于核糖体18S DNA和c DNA高通量测序的多样性异同。结果表明:形态鉴定获得8纲、20目、30科、36属共97种纤毛虫;DNA测序检获10纲、28目、55科、76属共174个OTUs;而通过c DNA测序获取的纤毛虫多样性最高,获10纲、31目、68科、99属共284个OTUs。研究发现,形态学方法检获的纤毛虫均为底栖生纤毛虫;两种分子手段检获的多样性更高,群落结构更为近似,覆盖了形态鉴定所获的绝大部分类群。但DNA测序还检获了序列比例高达90%的浮游类群,可能源于包囊或死亡沉降的物种;而c DNA测序检获了约7%的浮游纤毛虫序列。较之DNA测序,c DNA法检获的底栖纤毛虫在群落结构上与形态学结果更为接近。本研究表明,分子手段有助于更全面地揭示沉积物中的纤毛虫多样性,DNA测序可同时揭示休眠包囊、胞外DNA及过去群落的信息,而c DNA测序在研究活动纤毛虫多样性上更有优势。  相似文献   

致病性哈维氏弧菌:海洋寄生性纤毛虫的内共生细菌     

QIAO Ying  WANG Jun  MAO Yong  LIU Min  CHEN Ruanni  SU Yongquan  KE Qiaozhen  HAN Kunhuang  ZHENG Weiqiang 《海洋学报(英文版)》2017,36(10):115-119

哈维氏弧菌被观察到与海洋寄生性纤毛虫刺激隐核虫具有内共生现象,其作为一种致病性细菌,可导致感染刺激隐核虫的大黄鱼产生严重的继发性细菌感染。我们通过16s宏测序技术对刺激隐核虫的细菌群落进行鉴定,并通过标准的细菌培养方法分离鉴定出哈维氏弧菌。通过透射电镜和荧光原位杂交方法,在刺激隐核虫的细胞胞质中,均观察到内共生的哈维氏弧菌的存在;而在其细胞核中,则没有相关信号存在。哈维氏弧菌与刺激隐核虫的相关关系以及内共生的哈维氏弧菌对刺激隐核虫的影响作用,仍需要深入进行研究。  相似文献   

Prevalence of Bacillus sp. among the biofilm forming community on Ti surface in marine environment     

PRIYA Chokkalingam  ARAVIND Ganessin  THILAGARAJ Wilson Richard 《海洋学报(英文版)》2017,36(6):89-94

Prevalence of bacterial species involved in biomineralization of manganese on titanium (Ti) surfaces in marine environment was revealed in this research work. This study involves one year sea water exposure of Ti and their periodical biofilm characterization was carried out to quantify the manganese oxidizing bacterial (MOB) presence in the biofilm formed on titanium surfaces. The total viable count study of Ti coupons exposed to sea water for one year resulted in 60% of the MOB in overall biofilm population. The biochemical characterization of MOB isolates were performed for the genus level identification of the seven bacterial isolates. Further, the seven strains were subjected to 16S rRNA gene sequencing. Evolutionary analysis was performed using MEGA 7 to obtain closely related strains within the groups. The manganese oxidizing ability of the bacterial isolates were determined with Leucoberbelin Blue Assay (LBB) and Atomic Absorption Spectroscopy studies (AAS). The results show that among the isolated marine MOB species, Bacillus sp. and Leptothrix sp. have the maximum Mn oxidizing property. The microtitre plate assay was performed to determine the biofilm forming ability of the isolated marine MOB species. All the results have confirmed the prevalence of Bacillus sp. among the biofilm colonizers on Ti surfaces when exposed in sea water.  相似文献   

Target Deployment and Retrieval Using JIAOLONG Manned Submersible in the Depth of 6600 m in Mariana Trench     

GAO Xiang  DING Kang  REN Yu-gang  FU Wen-tao  DING Zhong-jun  ZHAO Sheng-y  LIU Bao-hua 《海洋工程》2017,31(5):618-623

China''s 7000 m manned submersible JIAOLONG carried out an exploration cruise at the Mariana Trench from June to July 2016. The submersible completed nine manned dives on the north and south area of the Mariana Trench from the depth of 5500 to 6700 m, to investigate the geological, biological and chemical characteristics in the hadal area. During the cruise, JIAOLONG deployed a gas-tight serial sampler to collect the water near the sea bottom regularly. Five days later, the sub located the sampler in another dive and retrieved it successfully from the same location, which is the first time that scientists and engineers finished the high accuracy in-situ deployment and retrieval using a manned submersible with Ultra-Short Base Line (USBL) positioning system at the depth more than 6600 m. In this task, we used not only the USBL system of the manned submersible but also a compound strategy, including five position marks, the sea floor terrain, the depth contour, and the heading of the sub. This paper introduces the compound strategy of the target deployment and retrieval with the practical diving experience of JIAOLONG, and provides a promising technique for other underwater vehicles such as manned submersible or Remote Operated Vehicle (ROV) under similar conditions.  相似文献   

高分辨率遥感影像目标分类与识别研究进展     

刘扬  付征叶  郑逢斌 《地球信息科学学报》2015,17(9):1080-1091

高分辨率遥感影像的目标分类与识别,是对地观测系统进行图像分析理解,以及自动目标识别系统提取目标信息的重要手段。本文综述了当前国内外在可见光、红外、合成孔径雷达和合成孔径声纳等遥感影像的目标分类与识别的关键技术和最新研究进展。首先,讨论了高分辨率遥感影像的目标分类与识别问题的主要研究层次和内容;其次,深入分析了高分辨率遥感影像目标分类与识别,在滤波降噪、特征提取、目标检测、场景分类、目标分类和目标识别的关键技术及其所存在的问题;最后,结合并行计算、神经计算和认知计算等技术,讨论了目标分类与识别的可行性方案。具体包括：（1）高性能并行计算在高分辨率遥感图像处理的主流技术,并给出了基于Hadoop+OpenMP+CUDA的高分辨率遥感影像混合并行处理架构;（2）深度学习对于提升目标分类和识别精度的应用前景,以及基于深度神经网络的多层次遥感影像目标识别方法;（3）认知计算在解决遥感影像大数据不确定性分析的模型与算法,并讨论了层次主题模型的多尺度遥感影像场景描述方案。此外,根据媒体神经认知计算的相关研究,探讨了遥感影像大数据的目标分类和识别的发展趋势和研究方向。  相似文献   

地理学时空数据分析方法   总被引：13，自引：4，他引：9  

王劲峰  葛咏  李连发  孟斌  武继磊  柏延臣  杜世宏  廖一兰  胡茂桂  徐成东 《地理学报》2014,69(9):1326-1345

随着地理空间观测数据的多年积累,地球环境、社会和健康数据监测能力的增强,地理信息系统和计算机网络的发展,时空数据集大量生成,时空数据分析实践呈现快速增长。本文对此进行了分析和归纳,总结了时空数据分析的7类主要方法,包括：时空数据可视化,目的是通过视觉启发假设和选择分析模型;空间统计指标的时序分析,反映空间格局随时间变化;时空变化指标,体现时空变化的综合统计量;时空格局和异常探测,揭示时空过程的不变和变化部分;时空插值,以获得未抽样点的数值;时空回归,建立因变量和解释变量之间的统计关系;时空过程建模,建立时空过程的机理数学模型;时空演化树,利用空间数据重建时空演化路径。通过简述这些方法的基本原理、输入输出、适用条件以及软件实现,为时空数据分析提供工具和方法手段。  相似文献   

框架剪力墙结构模态静力非线性抗震分析方法研究   总被引：5，自引：2，他引：3  

卢文生  吕西林 《地震工程与工程振动》2005,25(1):58-66

本文在模态pushover分析方法基础上推导建立了模态静力非线性分析方法,对一栋10层框架剪力墙结构进行了静力非线性分析,提出了目标位移求解的等效单自由度体系弹塑性时程分析迭代法,计算结果与相应时程分析结果进行了比较,表明两者吻合较好,验证了本文计算方法的有效性。另外,对同一结构,计算分析了在不同水平荷载模式下的静力非线性分析结果,比较不同荷载模式对计算结果的影响,为静力非线性分析方法的推广使用提供参考。  相似文献   

论个旧老矿区的新找矿方向   总被引：2，自引：0，他引：2  

吕宝善 《地质论评》2005,51(6):640-648

笔者通过对古地磁、氧同位素组成、稀土元素组成及成岩温度、Si0含量的变化规律以及花岗岩的侵入时代等方面的综合研究,总结出个旧东区及西区的花岗岩体是同源的花岗岩岩浆侵入演化形成的,同样是成矿母岩,都有利于个旧东区与西区锡多金属矿床的形成。笔者总结了个旧矿区的矿床类型及成矿规律。个旧矿区的原生矿床类型有：①产于碎屑岩中的裂隙脉型矿化;②产于石灰岩和白云岩中的层状—脉状、网脉状的气成—热液矿床;③产于花岗岩凹部及花岗岩突起顶部接触带矽卡岩中的接触交代矿床。个旧矿区的热液活动及热液蚀变作用很突出,花岗岩中的热液蚀变有：碳酸盐化、绿泥石化、云英岩化、绢云母化、钠长石化。其中碳酸盐化、云英岩化与锡、铜、钨矿化密切相关。笔者指出：在个旧矿区不论东区老矿区的深部及老矿山之间和外围还是整个西区都有进行新一轮找矿的必要性及可能性,而且提出个旧矿区的东区及西区新一轮找矿的方向和靶区。本文还指出在个旧矿区长期以来所划定的五子山复式背斜及贾沙复式向斜没有证据,应予以否定,包括应重新认识原来认为的仅局限于复背斜控制成矿的观点,开阔视野开展新一轮找矿。  相似文献   

海城市范家堡子滑石矿床外围找矿预测     

何忠波  王嵩莉  王东波  何伟  姜福伦 《吉林地质》2009,28(3):52-55

简单地介绍了矿床地质特征,详细地分析了矿床的构造特征,推测矿区为一北北东向—倒转向斜的一部分,在F2断层的东侧已控制矿体的下部倒转向斜的核部和另一翼为本区的找矿方向。  相似文献   

新疆恰尔隆地区化探与遥感信息综合应用和找矿预测   总被引：1，自引：0，他引：1  

朱余银 《矿产与地质》2009,23(1)

新疆恰尔隆地区属于西昆仑复合造山带中的构造岩浆成矿带,具有较好的成矿地质背景。在对区域成矿地质条件的综合研究基础上,通过对化探和遥感找矿信息的综合分析,圈定了3个具有成矿地质异常的找矿靶区,其中库克西力克南2km处为一最佳找矿靶区,取得了一定的实际应用效果。  相似文献